Fue suplente debido a la deteriorada relación con van Marwijk, aunque jugó 28 partidos de liga, segunda equipacion barcelona anotando 6 goles. En total jugó en 28 ocasiones, anotando 15 goles en su segunda temporada. Barcelona para esta temporada Ronald Koeman, quien dirigió anteriormente a la selección de los Países Bajos. Durante las primeras 10 jornadas de la temporada 2008-2009, el Villarreal se mantiene entre los dos primeros puestos, hasta que un Barça imparable lo adelanta.
