A comienzos de 1997, Pekerman lo convocó a la selección argentina sub-20 con motivo del Campeonato Sudamericano Sub-20 realizado en Chile. Riquelme jugó los nueve partidos del certamen y marcó 3 goles, camisetas barça destacándose su conquista frente a Brasil en la victoria por 2-0. Argentina se consagró campeón sudamericano después de 30 años. Como novedad del campeonato, segunda equipacion barcelona se instauraron los derechos clasificatorios del campeón defensor. En el verano de 1996, formó parte de un seleccionado argentino sub-18 dirigido por José Pékerman que disputó en Uruguay la «Copa Punta del Este» y se proclamó campeón desempeñándose como volante central.